Hello,<br><br>My protein have two identical chains A and B and the backbone rmsd between the two chains is 0.33A.<br>My problem is that how to select(on what basis) one chain out of the two for md simulation, whether the selection of one of the two<br>
chains(A or B) will make any differences to the final results.<br clear="all"><br>-- <br><span style="color:rgb(51, 51, 255)">-----------------------</span><br style="color:rgb(51, 51, 255)"><i><span style="color:rgb(51, 51, 255)">Regards,</span></i><br style="color:rgb(51, 51, 255)">
<span style="color:rgb(51, 51, 255);font-family:garamond,serif">Bipin Singh</span><br><br>