<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" id="owaParaStyle"></style>
</head>
<body fpstyle="1" ocsi="0">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">I am sorry if this is a simple question, but I have spent the better part of the day attempting to figure it out using gromacs mailing list..etc..
<div><br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<div>Here is the problem. When I attempt to run genbox my output produces the error that &quot;spc216.gro cannot be found in your GMXLIB path. Here is what I've done. My bashrc_profile has the following</div>
<div><br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<div>..</div>
<div>...</div>
<div>export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib</div>
<div><br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<div>export GMXLIB=/usr/local/gromacs/share/gromacs/top</div>
<div><br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<div>source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC</div>
<div><br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<div>...........</div>
<div><br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<div>I have checked and &quot;spc216.gro&quot; is in /usr/local/gromacs/share/gromacs/top</div>
<div><br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<div>The ff is found by pdb2gmx which is in the same location</div>
<div><br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<div>Can someone please help me?</div>
</div>
</body>
</html>