Dear users, <br><br>I am working on a protein which is a dimer (in the crystal structure), predicted according top PISA.<br>and some of the homologous proteins are dimers (covalent /non-covalent) some are monomers.<br>There has not been any literature regarding the fact that the functional unit is a dimer, ie the enzyme<br>
is not functional when the dimeric interface is disturbed due to mutations. Also the active sites are not<br>shared among the dimeric partners. In this situation is it meningful to do a simulation of monomers alone<br>and try to get some information.<br>
<br>In general is it necessary to simulate only the functional oligomers or monomer also can be done ?<br><br>Thanking you<br>With Regards<br>M. Kavyashree<br>