My simulation was performed within a triclinic box and I would like to reshape it into a rectangular box for post-processing analysis. I tried &quot;/trjconv -o traj.pdb -ur rect -pbc -mol &quot; but the new .pdb file still has triclinic geometry. Can someone please help?<div>
<br class="webkit-block-placeholder"></div><div>Thanks!</div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div>Max</div>