<p>Hey,</p>
<p>This is not a bug. Your residues both have number 1, and residue names are not atomic properties, so only the first name for a residue is saved and used when writing the output.<br>
To solve this, make sure that consecutive residues have different numbers.</p>
<p>Cheers,</p>
<p>Tsjerk </p>
<p><blockquote type="cite">On Aug 3, 2011 3:59 PM, &quot;Justin A. Lemkul&quot; &lt;<a href="mailto:jalemkul@vt.edu">jalemkul@vt.edu</a>&gt; wrote:<br><br><p><font color="#500050">

Justin A. Lemkul wrote:
&gt;
&gt;
&gt;
&gt; maria goranovic wrote:
&gt;&gt;
&gt;&gt; Thanks for the replies. I guess it is...</font></p>
In addition, you can always renumber any coordinate file using genconf -renumber for the purpose of creating index groups.<p><font color="#500050">

-Justin

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Justin A. Lemkul
Ph.D. Candidate
ICTAS Doct...</font></p></blockquote></p>