Dear all,<br>             I have generated .gro and .top file for Chloranil from prodrg  and tried solvate it using pre-equilibrated cyclohexane. When i tried to generate the box containing solute it is not modifying the .top file and it shows zero solvent.<br>
Please help me how to solvate organic molecules that are obtainde from prodrg.<br><br>Thank you.<br>