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Thanks a lot for your quick answer!<br>Best wishes,<br>Rebeca.<br><br><div>&gt; Date: Wed, 10 Aug 2011 14:34:42 -0400<br>&gt; From: jalemkul@vt.edu<br>&gt; To: gmx-users@gromacs.org<br>&gt; Subject: Re: [gmx-users] append files in Gromacs 3.3<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; Rebeca García Fandiño wrote:<br>&gt; &gt; Hello,<br>&gt; &gt; I have some old calculations (Umbrella Sampling) carried with Gromacs <br>&gt; &gt; 3.3.3 and I need to extend them.<br>&gt; &gt; I have tried to use the option "append" like in Gromacs 4.0, using:<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; mdrun -v -np 8 -s Cl-2.4750_b.tpr -pi Cl-2.4750.ppa -po pullout.ppa -pn <br>&gt; &gt; Cl-2.4750.ndx -pd -deffnm Cl-2.4750 -append<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; but it does not work, the output files are not appended to the first ones.<br>&gt; &gt; <br>&gt; <br>&gt; Right, because the -append option was added in version 4.0.<br>&gt; <br>&gt; &gt; Do you know how could append files in Gromacs 3.3?<br>&gt; &gt; <br>&gt; <br>&gt; Text files can be appended with standard Unix utilities like 'cat' while other <br>&gt; Gromacs output files can be appended with other Gromacs utilities (trjcat for <br>&gt; trajectories, eneconv for energy files).<br>&gt; <br>&gt; -Justin<br>&gt; <br>&gt; &gt; Thanks a lot for your help in advance.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Best wishes,<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Rebeca.<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Dr.Rebeca Garcia<br>&gt; &gt; Postdoctoral student<br>&gt; &gt; Santiago de Compostela University<br>&gt; &gt; Spain<br>&gt; &gt; <br>&gt; <br>&gt; -- <br>&gt; ========================================<br>&gt; <br>&gt; Justin A. Lemkul<br>&gt; Ph.D. Candidate<br>&gt; ICTAS Doctoral Scholar<br>&gt; MILES-IGERT Trainee<br>&gt; Department of Biochemistry<br>&gt; Virginia Tech<br>&gt; Blacksburg, VA<br>&gt; jalemkul[at]vt.edu | (540) 231-9080<br>&gt; http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin<br>&gt; <br>&gt; ========================================<br>&gt; -- <br>&gt; gmx-users mailing list    gmx-users@gromacs.org<br>&gt; http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<br>&gt; Please search the archive at http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search before posting!<br>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>&gt; www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br>&gt; Can't post? Read http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists<br></div>                                               </div></body>
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