Dear users,<br><br>I have done some 16 simulations of a protein with mutations,<br>by keeping the distance between protein atom and the simulation<br>box to be 1.0nm (i.e, -d option in editconf) but only in one of the <br>
simulation I found violation of minimum image distance. So Should<br>I increase the box size only for this or should I increase for all and <br>redo the simulations?<br><br>Thank you<br>With Regards<br>M. Kavyashree<br>