Dear all,<br>            When I use mdrun_d to generate NPT or NVT ensemble I am not getting the .xtc file(compressed trajectory file).<br>Further if I use .trr file to see the trajectory using VMD it shows nothing.<br><br>
I gave following command during mdrun,<br><br>mdrun_d -s *.tpr -x *.xtc -o *.trr -cpo *.cpt -e *.edr -c *.gro -n *.ndx<br><br>Is there anything wrong in the above commands or atleast why I am not able to view the trajectory using .trr file.<br>
Please suggest me something.<br><br>Thank you.<br><br>Ravi Kumar Venkatraman<br>