<style type="text/css">p { margin-bottom: 0.08in; }</style>

<p style="margin-bottom: 0in;">I am doing the protein in lipid
tutorial . <a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin/gmx-tutorials/membrane_protein/02_topology.html">http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin/gmx-tutorials/membrane_protein/02_topology.html</a><br>
<br>Pack the lipids around the protein, i dont see
where is the script perl <a href="http://inflategro.pl">inflategro.pl</a></p>
<p style="margin-bottom: 0in;">I googled It and did not find it. Can
you please send me the script or tell me where I can find it 
</p>
<p style="margin-bottom: 0in;"><br>
</p>
<p style="margin-bottom: 0in;">Also I used the cat KALP_newbox.gro
dppc128_whole.gro &gt; system.gro</p>

<p style="margin-bottom: 0in;">so I checked the  system.gro in vmd and
did not load anything. I was able to vew the  KALP_newbox.gro  and
the dppc128_whole.gro but not the  system.gro 
</p>

<p style="margin-bottom: 0in;"> do I have to organize the 
system.gro because I can see that the protein in numbered from 1 to …
then the lipids start from 1 ….end .. will that cause a problem 
</p>
<p style="margin-bottom: 0in;"><br>
</p>
<p style="margin-bottom: 0in;">Thank you 
</p>