Hello gmx-users,<div><br></div><div>I am trying to run a sequence of energy minimizations for a model polymer system. Currently, I do following steps manually:</div><div>step 1) I run an energy minimization for a configuration. (using mdrun option)</div>
<div>step 2) From the output of this configuration, I change something in the coordinate file then run the energy minimization. (using editconf option)</div><div><br></div><div>I want to automate this process since the delay between runs is ~15 minutes. My idea is that I can probably introduce time delay in scripts, but it would be nice if there&#39;s an option in GROMACS which allows for a sequence of mdruns. Does anyone aware of such option for GROMACS? </div>
<div><br></div><div>Greg</div>