Hi, ALL<div><br></div><div>      I have a question about the charge defined in the topology file.</div><div>      It seems to me that the charge for each atom apprears twice in different sections of the topology files.</div>
<div>------------------------------------------------------------------------------</div><div>      One is </div><div><div>[ atomtypes ]</div><div>;name     mass      charge   ptype   c6            c12</div></div><div><br>
</div><div>      The other is</div><div><div>[ atoms ]</div><div>; id    at type res nr  residu name at name cg nr   charge</div></div><div>------------------------------------------------------------------------------</div>
<div>       And the charge number in [ atomtypes ] are always 0.0.</div><div>       Which one is actually read by gromacs program ?</div><div><br></div><div>       Thanks,</div><div><br></div><div>        Guozhen Zhang</div>
<div><br></div>