Dear gmx-users,<div><br></div><div>I am pretty confused about how to calculate the surface tension of a bilayer which with its bilayer</div><div>normal in y-direction rather than z-direction (as the default). </div><div><br>
</div><div>How does the Surf*SurfTen option in g-energy work? Does it take z as a default bilayer normal?</div><div>If so, how can I calculate the surface tension in my case?</div><div><br></div><div>What if I use g_energy to get Pxx, Pyy and Pzz, than calculate my surface tension as:</div>
<div>gamma= (Pyy - (Pxx+Pzz)/2) * Lz</div><div>What exactly is the &quot;Lz&quot;? Is it the length of the bilayer normal or the length of either box-x or box-z</div><div>(in my case are the bilayer plane).   <br clear="all">
<div><br></div><div>I will be vary thankful if anyone would kindly help me or discuss it with me.</div><div>Thank you for your precious time.</div><div><br></div><div>Joanne</div>-- <br><span style="border-collapse:collapse;color:rgb(136, 136, 136);font-family:arial, sans-serif;font-size:13px"><br>
<br></span><br>
</div>