<br><br><div class="gmail_quote">On Sat, Sep 10, 2011 at 3:35 AM, Moeed <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:lecielll@googlemail.com">lecielll@googlemail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
Dear users,<br><br>I have created radial distribution function plot for Carbon atoms in a system containing polymer chains. I see some little jumps between first and second peak. <br>I need your help to comment on how this behavior can be justified (or if the plot is wrong).<br>



<p><span style="font-family:&quot;Book Antiqua&quot;,&quot;serif&quot;">g_rdf -f *.trr
-s *.tpr -o *.xvg
-</span><span style="font-family:&quot;Book Antiqua&quot;,&quot;serif&quot;" lang="EN-US">n *.ndx –b xxx </span><span style="font-family:&quot;Book Antiqua&quot;,&quot;serif&quot;" lang="EN-US"> </span><span style="font-family:&quot;Book Antiqua&quot;,&quot;serif&quot;"></span></p>



Thank you in advance.<br></blockquote><div><br>I think your figure is fine.<br><br>You just need how to proper interpret your figures, truly understand what the &quot;radial distribution&quot; means. <br> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
<br><br>
<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Best Regards,<br><br>lina<br>
<br><br>