Hi all,<br><br>I want to apply different values of LJ and QQ scaling factors for two interacting molecules A and B. Since I already have the .itp files for each molecule, should I just add something like:<br><br>[ defaults ]<br>

; nbfunc        comb-rule       gen-pairs       fudgeLJ  fudgeQQ<br>   1                    2                     yes             0.5            0.8333<br><br>at the very beginning of A.itp and B.itp respectively (the actual values are different from this eg.)?<br>

<br>I wonder if .itp file format was designed for this kind of purpose? :)  I guess we could even define different sets of atom types for A and B, right?<br><br>Thanks,<br>Yun<br><br>