Mark,<div><br></div><div>i read the help but i still didnt understand how do i compute the time series for this data, should i use this data as such for the input?</div><div><br></div><div>Thanks,<br><br><div class="gmail_quote">
On Mon, Sep 26, 2011 at 12:44 PM, Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<div><div></div><div class="h5">On 26/09/2011 5:10 PM, aiswarya pawar wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
HI Mark,<br>
<br>
i have a .xvg data for the distance of two atoms in each time frame.<br>
<br>
<br>
0.000000e+00  7.191033e-01<br>
1.000000e+00  7.304224e-01<br>
2.000000e+00  8.983867e-01<br>
3.000000e+00  8.779736e-01<br>
4.000000e+00  8.236583e-01<br>
5.000000e+00  8.298320e-01<br>
6.000000e+00  7.703011e-01<br>
7.000000e+00  8.569826e-01<br>
8.000000e+00  7.428180e-01<br>
9.000000e+00  7.487683e-01<br>
1.000000e+01  8.106729e-01<br>
1.100000e+01  8.702058e-01<br>
1.200000e+01  8.823072e-01<br>
1.300000e+01  8.902194e-01<br>
1.400000e+01  6.122664e-01<br>
1.500000e+01  5.804662e-01<br>
1.600000e+01  6.207849e-01<br>
1.700000e+01  4.852896e-01<br>
1.800000e+01  5.297776e-01<br>
1.900000e+01  5.432515e-01<br>
2.000000e+01  5.888653e-01<br>
2.100000e+01  4.620140e-01<br>
<br>
<br>
Now i want to find the autocorrelation of the time frame. so i should provide this file as such for input in g_analyze ie x as time and y as distance? or are there any criteria for the g_analyze input.<br>
</blockquote>
<br></div></div>
Have you read g_analyze -h and tried it out?<div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
Mark<br>
-- <br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/<u></u>mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Support/Mailing_Lists</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>