HI,<div><br></div><div>I have tried simulating my protein (GFP) solvated with water molecules and 10 phosphate ions. During the md run step the system starts exploding after  500 ps. What could be the reason for this . I know this is happening due to the addition of phosphate ion but I need to study the binding of ions . So, what shall I do ??</div>
<div><br></div><div>Regards<br clear="all"><div><br></div>-- <br>Bharat<br>Ph.D. Candidate<br><br>
</div>