Dear All,<br>             <br>             I am doing NVT equilibration for Ethanol of cubic box of side length 6.10346 nm in OPLSAA ff after doing the Energy Minimisation. My system getting blown up when I do NVT equilibration.<br>
Following are the some parameters that I have mentioned in *.mdp files,<br><br>100 ps run in 2 fs steps.<br><br>cut-off length was 1.0 nm.<br><br>Berendsen Thermostat at 298.15 k with 0.1 ps time constant.<br><br>lincs constraint for all-bonds.<br>
<br>Please suggest me something so that I can simulate without blowing up my system.<br><br>Thank you,<br><br>With Regards,<br><br>Ravi Kumar Venkatraman.<br><br><br>