Dear All<div>I want to refine a protein homology model, I did minimization but then procheck does not give better Ramachandran plot. This model is a homodimer with each chain of 609 residue and a total of 1218 residue so a long MD simulation to search native state is not feasible. Can any one help me on this list to tell that how should I attempt this problem.</div>
<div>Shahid Nayeem</div>