Hi<br>i am trying to study protein-ligand interaction.<br>at the end of the simulation, the visualization via- VMD shows, some of the atoms suddenly jumped from its place to another space for a short time and comes back to its position connected by huge lines. i dont have any idea what is the real technical term to describe that.<br>
i am not sure where i am making mistake.<br>could any one suggest this how to tackle this problem.<br clear="all">thanks <br>Parthiban<br><br>