<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div>you either&nbsp; </div><div><br></div><div>A) Have not been sampling long enough</div><div><br></div><div>or</div><div><br></div><div>B) Just might have your answer...</div><br><div><div>On Oct 10, 2011, at 11:46 AM, Liu, Liang wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><font class="Apple-style-span" color="#000099" face="verdana, sans-serif">Well, the thing is even I turn off the position restraint and raise the temperature to 600k, the RMSD I can obtained is only about 0.3 for a RNA hairpin.</font> -- <br>gmx-users mailing list &nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search before posting!<br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br>Can't post? Read http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</blockquote></div><br></body></html>