<font color="#000099"><font face="verdana,sans-serif">Hi, all,</font></font><div><font color="#000099"><font face="verdana,sans-serif"><br></font></font></div><div><font color="#000099"><font face="verdana,sans-serif">I am trying to use Gromacs to obtain structural ensembles around native structures (PDB structures).</font></font></div>
<div><font color="#000099"><font face="verdana,sans-serif">However the simulated structures are always very close to the initial one, with RMSD &lt; 0.2.</font></font></div><div><font color="#000099"><font face="verdana,sans-serif">I am wondering how to obtain large-RMSD structures? Thanks.<br clear="all">
</font></font><div><br></div>-- <br>Best,<br>Liang Liu<br>
</div>