Justin,<br><br><br>So It seems that I&#39;ve done all steps in accordance to that workflow  and there have not been any more  errors during loading my system in the gromp. :)<br><br>By the way I have some methodological questions<br>
<br>1- Could you provide me with the source of the initial single lipids? Previously I&#39;ve done my system based on the VMD plugin for bilayer constructing but I want to find single lipids and prepared my system by-hands. <br>
<br>2- Could you tell me other possible methods for self bi-layer preparation starting from initial single lipid molecule ?<br><br><br>Thanks again,<br><br><br>James<br>