<p>Hi,</p>
<p>You don&#39;t need a .tpr file for removing jumps; a pdb/gro file will do.</p>
<p>Cheers,</p>
<p>Tsjerk</p>
<p><blockquote type="cite">On Oct 24, 2011 2:51 PM, &quot;Justin A. Lemkul&quot; &lt;<a href="mailto:jalemkul@vt.edu">jalemkul@vt.edu</a>&gt; wrote:<br><br><p><font color="#500050">

Steven Neumann wrote:
&gt;
&gt; Dear Gmx Users,
&gt;  I am trying to convert my trajectory using trjconv.  ...</font></p>
trjconv -dump 0<p><font color="#500050">

&gt;
&gt; 3. Remove jumps if you want to have them removed using the first frame
&gt;
&gt;  
&gt; trjconv -f traj...</font></p>
Recreate the .tpr file using the coordinate file produced in (2).<br>
<br>
-Justin<br>
<br>
-- <br>
==============================<u></u>==========<br>
<br>
Justin A. Lemkul<br>
Ph.D. Candidate<br>
ICTAS Doctoral Scholar<br>
MILES-IGERT Trainee<br>
Department of Biochemistry<br>
Virginia Tech<br>
Blacksburg, VA<br>
jalemkul[at]<a href="http://vt.edu" target="_blank">vt.edu</a> | <a href="tel:%28540%29%20231-9080" value="+15402319080" target="_blank">(540) 231-9080</a><br>
<a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin" target="_blank">http://www.bevanlab.biochem.<u></u>vt.edu/Pages/Personal/justin</a><br>
<br>
==============================<u></u>==========<br><font color="#888888">
-- <br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/<u></u>mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
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</font></blockquote></p>