<style type='text/css'>
.TerraceMsg { font-size: 12px; font-family:Dotum, Arial, Verdana, Sans-Serif;}
.Bold { font-weight: bold; }
</style><div class='TerraceMsg'>Dear members of gromacs<br />
<br />
Let you know that I'm a beginner of Gromacs.<br />
<br />
I am trying to simulate the diffusion problem on some zeolite structure. (especially ZSM-22)<br />
<br />
>From the manual, I knew that the three files are required to get the .tpr input file.<br />
I got the .pdb file of my concerned zeolite (zsm-22) but it is  impossible to get .top file by using the pdb2gmx because the .pdb file  is just coornate file.<br />
<br />
Therefore, my question is how can I get the .top file??<br />
I already tried the g_x2top -f zeo.pdb -o out.top -ff oplsaa <br />
but errors were shown <br />
<br />
&quot;Can not find forcefield for atom ~~~~&quot;<br />
<br />
please let me know how to do it....<br />
<br />
Thx.</div><br><br><br><br><table border=0 cellpadding=0 cellspacing=0 >
<tr><td>
<img src="cid:190153616-12032001-102629920118001" border=0></td><td width=10></td><td style='vertical-align: top;font-size:9pt;'>
Kiwoong, Kim.
No. 409/Ricci Hall/Dept. of Chemical & Biomolecular Engineering/
Sogang University/Sinsoo-Dong/Mapo-Gu/Seoul 121-742/ Korea
(office) +82-2-705-8477
(CP) +82-10-8714-2208
(fax) +82-2-3272-0319
(E-mail) kimkw@sogang.ac.kr</td></tr></table>
<br>
<div id='TMSMDN' style="background:url('http://mail.sogang.ac.kr:80/mail/receiveMDN.do?mdnData=gxC%2FAjm5ZeEofbxtGCj1JfarXwQmgqSIuahNzqtEqz3m6SisyyK8FD2ocieSxl5jMqVtPNMRgum%2F%0Atry7umZo3qBbMGiESXyPvbxJh%2Fg%2BzK%2FiZDu2rB4El18Xbt4BZMQnFm1PN561arvosdDIIunU0an8%0AXY4JLxE%2FktAaM2XK9UM%3D%0A')"/>