<style type='text/css'>
.TerraceMsg { font-size: 12px; font-family:Dotum, Arial, Verdana, Sans-Serif;}
.Bold { font-weight: bold; }
</style><div class='TerraceMsg'>Dear members of gromacs<br />
<br />
Hi, I'm a beginner of gromacs.<br />
<br />
I want to simulate the diffusion problem when the particle diffuses into the cylinder pore which has the implicit wall (with some atoms).<br />
<br />
The diffusing particle has to be updated during the integration step but the particle on the implicit wall must not be updated.<br />
Hence, I don't know how I can do this kind of thing. <br />
Is there any function to handle the implicit wall that must be rigid and not to be updated ? <br />
<br />
Thx. <br /></div><br><br><br><br><table border=0 cellpadding=0 cellspacing=0 >
<tr><td>
<img src="cid:657514716-12032001-102629920118001" border=0></td><td width=10></td><td style='vertical-align: top;font-size:9pt;'>
Kiwoong, Kim.
No. 409/Ricci Hall/Dept. of Chemical & Biomolecular Engineering/
Sogang University/Sinsoo-Dong/Mapo-Gu/Seoul 121-742/ Korea
(office) +82-2-705-8477
(CP) +82-10-8714-2208
(fax) +82-2-3272-0319
(E-mail) kimkw@sogang.ac.kr</td></tr></table>
<br>
<div id='TMSMDN' style="background:url('http://mail.sogang.ac.kr:80/mail/receiveMDN.do?mdnData=gxC%2FAjm5ZeEofbxtGCj1JRHj5UfyeduDYW%2BcSfkjnexHJv5O3Dv6t2h7d9AMtEpLKvPeWC73vPoj%0APLjFHpuuxyK0L4%2F%2FGeC18yzkU1Bo9skTwzBTZj9pXX8QnOSVwmIIZbd%2BDdqr%2Bhzjk3SNPg3ulo1v%0AlE2hhuDyQaeMvlZ5RUc%3D%0A')"/>