<div dir="ltr"><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">Greeting<br>I&#39;m doing a MD simulation of a monomeric protein and i got different results about hydrogen bonding from what another team has found (they use other MD software ) , for example i find a Hydrogen bound between K 77 - Asp 81 and they find K 77 - R 82, my question is :<br>

Is hydrogen bounding different from one simulation to another (with the same running time) and if not are hey different from one software to another ?<br>If so, when publishing results is it scientifically credible to publish value that are different arguing that internal gromacs mechanism of computation are different then their home-built software?<br>

thank for responding and good work , Gromacs is really great piece of art :) .<br><br></div>
</div><br></div>