Hello everyone,<br><br>I just have a quick question. So the fudgeQQ value for amber99sb force field in gromacs is 0.8333, but I wonder if we should use 0.833333 or 0.83333333?<br><br>I quite different simulation results by manipulating this value. In my antibody - ligand system, 0.8333 showed ligand not stable, dropping out of the binding site, while 0.83333333 showed the same ligand fairly stable. The trajectories are about 50 ns long.<br>

<br>Thanks for any suggestion.<br><br>Yun<br>