<br>Hi GROMACS users,<br><br>    i am in the midst of simulating  a protein in water.  I have modified  a residue  in my  pdb file at position  182,  using amber and then acpype.py.  But  after running  the energy minimization step,using  em.mdp file  generated from acpype , following error comes.<br>
<br>Steepest Descents:<br>   Tolerance (Fmax)   =  1.00000e+03<br>   Number of steps    =         5000<br>Step=   17, Dmax= 1.5e-06 nm, Epot=  9.89827e+17 Fmax=         inf, atom= 2700<br>Stepsize too small, or no change in energy.<br>
Converged to machine precision,<br>but not to the requested precision Fmax &lt; 1000<br><br>Double precision normally gives you higher accuracy.<br><br>writing lowest energy coordinates.<br><br>Steepest Descents converged to machine precision in 18 steps,<br>
but did not reach the requested Fmax &lt; 1000.<br>Potential Energy  =  9.8982703e+17<br>Maximum force     =            inf on atom 2700<br>Norm of force     =  1.7474532e+19<br> The mdp file is attached.<br><br>                                   Please help.<br>
                                                                                                                                                                                Madhumita Das<br><br>