Hi all. Justin, thank you for you quick respons )))<br>I want to clarify a situation with a number of ligands I can use in one simulation. I have got files of 3 ligands converted from amber files to gromacs with <a href="http://amb2gmx.pl">amb2gmx.pl</a> script. To include this files in the topology file I changed the extension of this files from top to itp. Is it possible to include several .itp files in the section:<br>
; Include forcefield parameters<br>#include &quot;***.ff/forcefield.itp&quot;<br>#include &quot;lig1.itp&quot;<br>#include &quot;lig2.itp&quot;<br>#include ....<br>In this case I&#39;ve got an error with order of inputs...<br>
Or I can add this topologies as top files in the section [ molecules ]...?<br>Thank you<br><br>-- <br><div style="text-align: left; font-family: arial,helvetica,sans-serif;">
<div style="text-align: right;"><font size="1"><i></i></font><font size="1"><i></i></font> </div><font size="1"><i><br><br>Nemo me impune lacessit</i></font></div><br>