Hello,<div><br></div><div>I am running MDs on a linux PC with OpenSuse, using:</div><div><br></div><div>mpirun -np 4 mdrun -v -dlb auto -reprod ....</div><div><br></div><div>If I repeat the calculation on the same PC, I get the same result. If I change to another PC with RedHat I get a different result. More specifically, I am calculating a deviation from experiment, which varies by ~20 % on changing operating systems (pretty much the same hardware on both PCs). Is there any way to avoid such variations? I guess I am missing something in the mdp file, which is: </div>
<div><br></div><div><div>cpp                 =  /usr/bin/cpp -traditional</div><div>integrator               = sd</div><div>tinit                    = 0</div><div>dt                       = 0.002</div><div>nsteps                   = 1000000</div>
<div><br></div><div>nstcomm                  = 1</div><div>nstcalcenergy            = 1</div><div>nstxout                  = 5</div><div>nstvout                  = 100</div><div>nstlog                   = 100</div><div>nstenergy                = 100</div>
<div><br></div><div>nstlist                  =  5</div><div>ns_type                  = grid</div><div><br></div><div>pbc                      = xyz</div><div>rlist                    = 0.9</div><div><br></div><div>optimize_fft             = yes</div>
<div>coulombtype              = pme</div><div>rcoulomb                 = 0.9</div><div>epsilon-r                = 1</div><div>rvdw                     = 0.9</div></div><div><br></div><div><div>constraints              = all-bonds</div>
<div>constraint-algorithm     = Lincs</div><div><br></div><div>unconstrained-start      = yes</div><div>lincs-warnangle          = 30</div></div><div><div><br></div><div>tc_grps                  = System</div><div>tau_t                    = 0.1</div>
<div>ref_t                    = 300.0</div><div><br></div><div>Pcoupl                   = parrinello-rahman</div><div>tau_p                    = 2</div><div>compressibility         = 4.5e-05</div><div>ref_p                    = 1.0</div>
<div><br></div><div>gen_vel                  = yes</div><div>gen_temp                 = 300.0</div><div>gen_seed                 = 173529</div><div><br></div><div><br></div></div><div>Many thanks for your help,</div><div>
Igor</div>