<br>Dear GROMACS users,<br><br><br>Is anyone aware of any benchmark analysis about the implementation of the amber99sb force field (or any of its variants: 99sb-ildn, 99sb-nmr) in GROMACS and AMBER. I am interested to know in what extend the energies correlate and if the results agree with experimental data. Differences in speed would be also interesting but of secondary importance.<br>
<br>thanks in advance.<br>Thomas<br><br><br><br clear="all"><br>-- <br>


        
        
        
        

<p style="margin-bottom:0cm" align="LEFT">======================================================================</p>
<p style="margin-bottom:0cm" align="LEFT">Thomas Evangelidis</p>
<p style="margin-bottom:0cm" align="LEFT">PhD student</p>
<p style="margin-bottom:0cm" align="LEFT">Biomedical Research
Foundation, Academy of Athens</p>
<p style="margin-bottom:0cm" align="LEFT">4 Soranou Ephessiou , 115 27
Athens, Greece<br><br>email: <a href="mailto:tevang@bioacademy.gr" target="_blank">tevang@bioacademy.gr</a></p>
<p style="margin-bottom:0cm" align="LEFT">                 <a href="mailto:tevang3@gmail.com" target="_blank">tevang3@gmail.com</a></p>
<p style="margin-bottom:0cm" align="LEFT"><br>website:
<a href="https://sites.google.com/site/thomasevangelidishomepage/" target="_blank">https://sites.google.com/site/thomasevangelidishomepage/</a></p>
<p style="margin-bottom:0cm" align="LEFT"><br>
</p>
<br>