<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:arial, helvetica, sans-serif;font-size:10pt"><div><span>Hi, have you tried to see the graphic with xmgrace using the flag "-nxy"? I had the same problem my first time.</span></div><div><span><br></span></div><div><span>Best regards.</span></div><div><br></div>  <div style="font-size: 10pt; font-family: arial, helvetica, sans-serif; "> <div style="font-size: 12pt; font-family: 'times new roman', 'new york', times, serif; "> <font size="2" face="Arial"> <hr size="1">  <b><span style="font-weight:bold;">De:</span></b> "Poojari, Chetan" &lt;c.poojari@fz-juelich.de&gt;<br> <b><span style="font-weight: bold;">Para:</span></b> "gmx-users@gromacs.org" &lt;gmx-users@gromacs.org&gt; <br> <b><span style="font-weight: bold;">Enviado:</span></b> lunes 21 de noviembre de 2011 15:42<br> <b><span style="font-weight: bold;">Asunto:</span></b> [gmx-users] g_helixorient<br> </font> <br>Hi,<br><br>I have
 a peptide inserted in membrane would like to analyze the peptide tilt.<br><br>The command i have used to do this is :<br><br>g_helixorient&nbsp; -s .tpr&nbsp; -f .xtc&nbsp; -n .ndx&nbsp; -otilt<br><br>Index file contains all carbon alpha atoms of the helix.<br><br>When i plot the tilt.xvg in xmgrace,&nbsp; i simply cannot obtain anything more than zero line graphic.<br><br>My tilt.xvg file contains:<br><br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  20&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  0&nbsp; &nbsp; 6.71663331985&nbsp; &nbsp; 7.67159080505&nbsp; &nbsp; 7.11331129074&nbsp; &nbsp; 6.48267745972&nbsp; &nbsp; 6.50307703018&nbsp; &nbsp; 3.75021958351&nbsp; &nbsp; 3.11895847321&nbsp; &nbsp; 4.27641773224&nbsp; &nbsp; 4.94620418549&nbsp; &nbsp; 6.23851776123&nbsp; &nbsp; 7.12995672226&nbsp; &nbsp; 13.8778572083&nbsp; &nbsp; 53.7828483582&nbsp; &nbsp;  151.92010498&nbsp; &nbsp; 19.5190696716&nbsp; &nbsp; 15.4049606323&nbsp;
 &nbsp;  19.654499054&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; 0<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  40&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;  0&nbsp; &nbsp; 13.8856639862&nbsp; &nbsp; 8.50883388519&nbsp; &nbsp; 3.26247763634&nbsp; &nbsp; 5.69738864899&nbsp; &nbsp; 13.2208509445&nbsp; &nbsp; 17.3268871307&nbsp; &nbsp; 15.3818006516&nbsp; &nbsp; 14.5039892197&nbsp; &nbsp; 15.0511980057&nbsp; &nbsp; 15.6195802689&nbsp; &nbsp;  13.389333725&nbsp; &nbsp; 9.22294712067&nbsp; &nbsp; 50.3538093567&nbsp; &nbsp; 170.862670898&nbsp; &nbsp;  45.268119812&nbsp; &nbsp; 47.6134376526&nbsp; &nbsp; 48.8991851807&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; 0<br> .<br>.<br>.<br>.<br>.<br><br>Please can i know what might have gone wrong.<br><br><br>Kind
 Regards,<br>Chetan.<br><br>------------------------------------------------------------------------------------------------<br>------------------------------------------------------------------------------------------------<br>Forschungszentrum Juelich GmbH<br>52425 Juelich<br>Sitz der Gesellschaft: Juelich<br>Eingetragen im Handelsregister des Amtsgerichts Dueren Nr. HR B 3498<br>Vorsitzender des Aufsichtsrats: MinDirig Dr. Karl Eugen Huthmacher<br>Geschaeftsfuehrung: Prof. Dr. Achim Bachem (Vorsitzender),<br>Karsten Beneke (stellv. Vorsitzender), Prof. Dr.-Ing. Harald Bolt,<br>Prof. Dr. Sebastian M. Schmidt<br>------------------------------------------------------------------------------------------------<br>------------------------------------------------------------------------------------------------<br>--<br>gmx-users mailing list&nbsp; &nbsp; <a ymailto="mailto:gmx-users@gromacs.org"
 href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>www interface or send it to <a ymailto="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br><br><br> </div> </div>  </div></body></html>