Hi Gromacs Users<br><br>I have a query regarding g_sas which i intend  to use for my MM/PBSA calcualtion<br><br>i am planing to use g_sas for calculating the SASA using a probe 
radius of 0.14 nm is this okay ????? o<br>

secondly  <br>∆Gsolv,np = 0.00542*SASA + 0.92 is this master equation right <br>third and important <br>(1) first i calculate for PTN+water and get the SASA for protein<br>(2 )   i calculate  for LIgand +water and get the SAS for Ligand<br>


(3) I calculate Ptn+ligand+water and choose PTN+LIgand and get the SASA for  P+ L right ???<br>(4) and the final SASA as  <br>    <br><pre><i><i>(Delta SASA)=SASA(protein)+SASA(ligand)-SASA(protein+ligand)*</i></i></pre>
is this the right procedure. <br><br><br>R.S.K.Vijayan<br>