<p>Hi Jose,</p>
<p>Check g_rmsdist -h<br>
Not sure about the references though.</p>
<p>Cheers,</p>
<p>Tsjerk</p>
<p><blockquote type="cite">On Nov 22, 2011 3:23 PM, &quot;Jose Borreguero&quot; &lt;<a href="mailto:borreguero@gmail.com">borreguero@gmail.com</a>&gt; wrote:<br><br><font color="#000099">Dear Gromacs users,<br></font><font color="#000099"><br>
Is there any algorithm/procedure to calculate NOEs
 from an MD trajectory? I&#39;d greatly appreciate any references where the 
algorithm is described.<br>
<br>Best regards,<br clear="all"></font><span style="color:rgb(0,0,153)">Jose M. Borreguero</span><br>
<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></p>