
<html>

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    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"

      http-equiv="Content-Type">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">

    On 24/11/2011 1:50 PM, NG HUI WEN wrote:

    <blockquote

cite="mid:4F0F9EF741BF744489429BD6F74DA59F01A34C@MAILBOX2.nottingham.edu.my"

      type="cite">

      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;

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        medium)">

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      <div class="WordSection1">

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">Dear Mark, <o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">Many thanks for

            taking the time to answer my question.<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">I&#8217;ve had a look

            at the link. However, as the g_helixorient output files are

            a little &#8220;unconventional-looking&#8221;, I am not sure if gnuplot

            could handle them.<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">This is how my

            bending.xvg file looks like when I view it on my linux

            terminal<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 15.5414686203&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            13.9671831131&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.49754190445&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.83397710323&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.68<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">052530289&nbsp;&nbsp;

            0.683569073677&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.43345403671&nbsp;&nbsp;&nbsp; 8.25963497162&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            5.08707904816&nbsp;&nbsp;&nbsp; 13.3334512711&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7.34296607971&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            2.19187068<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">939&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            2.44664645195&nbsp;&nbsp; 0.202708780766&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.66099739075&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            10.3064308167&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.37143564224&nbsp;&nbsp; 0.971765637398&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            12.6073293686<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">81.1007080078&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            66.1958847046&nbsp;&nbsp;&nbsp; 28.0650749207&nbsp;&nbsp;&nbsp; 12.9960222244&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            16.3757514954&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;0<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">&nbsp;

            100.000007629&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            2.19846844673&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.11483025551&nbsp;&nbsp; 0.664996445179&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            1.77089393139&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.45<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">826148987&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            5.11829614639&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.50709962845&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.90959501266&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            4.06375169754&nbsp;&nbsp;&nbsp; 9.80808544159&nbsp;&nbsp;&nbsp; 12.7944087982&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            2.6745197<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">773&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            4.58594942093&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.63769423962&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.60466551781&nbsp;&nbsp;

            0.494560062885&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.87983322144&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.39179229736&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            17.8020935059<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">89.3860473633&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            78.2087173462&nbsp;&nbsp;&nbsp; 22.6202278137&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7.18984699249&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            2.18211603165&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">&nbsp;

            200.000015259&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            11.4898967743&nbsp;&nbsp;&nbsp; 14.8035535812&nbsp;&nbsp;&nbsp; 11.0557250977&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            4.95649862289&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.58<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">447694778&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            8.45914077759&nbsp;&nbsp;&nbsp; 5.94662857056&nbsp;&nbsp; 0.607162833214&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            2.6271879673&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 8.9500579834&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.29822874069&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7.87417221<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">069&nbsp;&nbsp;

            0.892409682274&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7.41711711884&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.01197814941&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            7.29352807999&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3.83971619606&nbsp;&nbsp; 0.767958164215&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            15.4690599442<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">87.5663528442&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            73.4160614014&nbsp;&nbsp;&nbsp; 24.1331748962&nbsp;&nbsp;&nbsp; 8.33314704895&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            2.42648363113&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            300&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 12.7444248199&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            11.3533630371&nbsp;&nbsp;&nbsp; 6.02183914185&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.64138007164&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.24<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">458372593&nbsp;&nbsp;

            0.375344187021&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.73659491539&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.94989299774&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            5.81749725342&nbsp;&nbsp;&nbsp; 16.2174777985&nbsp;&nbsp;&nbsp; 8.22213363647&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            4.51266765<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D">594&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            4.29477596283&nbsp;&nbsp;&nbsp; 7.25417470932&nbsp; &nbsp;&nbsp;12.5503282547&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            5.51523017883&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.4407377243&nbsp;&nbsp;&nbsp; 9.50404548645&nbsp;&nbsp;&nbsp;

            17.9626598358&#8230; &#8230; &#8230;<o:p></o:p></span></p>

        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span><br>

        </p>

      </div>

    </blockquote>

    <br>

    This is not really a GROMACS question... but with gnuplot:<br>

    <br>

    plot 'file.xvg' using 1:2, 'file.xvg' using 1:3, ...<br>

    <br>

    Mark<br>

  </body>

</html>