<div>dear teacher,</div><div>when i do remd  in the  npt ensemble.</div><div><br></div><div>REMD: NPT -replex 4000</div><div>dt= 0.0001</div><div><br></div><div>step 172000, will finish Sat Dec 31 18:44:12 2011</div><div><br>
</div><div>-------------------------------------------------------</div><div>Program mdrun_mpi_4.5.5, VERSION 4.5.5</div><div>Source code file: nsgrid.c, line: 549</div><div><br></div><div>Range checking error:</div><div>
Explanation: During neighborsearching, we assign each particle to a grid</div><div>based on its coordinates. If your system contains collisions or parameter</div><div>errors that give particles very high velocities you might end up with some</div>
<div>coordinates being +-Infinity or NaN (not-a-number). Obviously, we cannot</div><div>put these on a grid, so this is usually where we detect those errors.</div><div>Make sure your system is properly energy-minimized and that the potential</div>
<div>energy seems reasonable before trying again.</div><div><br></div><div>how could  i do except using the small dt ? </div><div><br></div><div>thanks!</div><div><div>Bo Du</div><div>Department of Polymer Science and Engineering,</div>
<div>School of Chemical Engineering and technology,</div><div>Tianjin University, Weijin Road 92, Nankai District 300072,</div><div>Tianjin City P. R. China</div><div>Tel/Fax: +86-22-27404303 ; +8613820062885</div><div>E-mail: <a href="mailto:2008dubo@gmail.com">2008dubo@gmail.com</a> ; <a href="mailto:dubo2008@tju.edu.cn">dubo2008@tju.edu.cn</a></div>
</div>