Dear Gmx Users,<br><br>I am wondering how many of you faced a problem when you do not have a crystal structure of the protein of your interest. I am simulating terminal (app. 150 residues) of a compact protein which is said to represent the loops. I obtained such model via I-TASSER and QUARKS and that looks really consistent. Would you trust those servers which generate 3D models from the sequence when you consider terminal?<br>
Do you know any experiment which is able to validate it or a toold?<br><br>I know that this is gmx list but I am wondering if there is anyone who obtained reliable results from the simulations based on predicted model from sequence.<br>
<br>Thank you,<br><br>Steven<br>