<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div><span>Hello dear GMX Users,</span></div><div><br><span></span></div><div>Through scripting, I have an itp-like file to restrain all atoms that are NOT within a 30 angstroms radius from the center (a trimmer + water + ions).</div><div>This selection includes both protein and solvent atoms, which may be a problem when assigning this selection to the TOP file.</div><div>Is there a way to include this whole selection into the top file directly? Where/how could that be? <br></div><div>I've searched for solutions for a while, with no avail.<br></div><div><br></div><div>Thanks,</div><div><br><span></span></div><div><span><br></span></div><div>&nbsp;</div><div><font size="1"><i></i></font><font size="1"><i></i></font><div style="font-family: times new roman,new york,times,serif; font-size: 14pt;"><style><!--filtered
 {font-family:"Cambria Math";panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}filtered {font-family:Calibri;panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal        {margin-top:0cm;margin-right:0cm;margin-bottom:10.0pt;margin-left:0cm;line-height:115%;font-size:11.0pt;font-family:"sans-serif";}a:link, span.MsoHyperlink        {color:blue;text-decoration:underline;}a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed        {color:purple;text-decoration:underline;}.MsoChpDefault        {}.MsoPapDefault        {margin-bottom:10.0pt;line-height:115%;}filtered {margin:70.85pt 3.0cm 70.85pt 3.0cm;}div.Section1        {}--></style><style><!--filtered {font-family:"Cambria Math";panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}filtered {font-family:Calibri;panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal        {margin-top:0cm;margin-right:0cm;margin-bottom:10.0pt;margin-left:0cm;line-height:115%;font-size:11.0pt;font-family:"sans-serif";}.MsoChpDefault        {}.MsoPapDefault        {margin-bottom:10.0pt;line-height:115%;}filtered
 {margin:70.85pt 3.0cm 70.85pt 3.0cm;}div.Section1        {}--></style><div class="MsoNormal" style="margin-bottom: 0.0001pt; line-height: normal;"><span style="font-size: 8pt;" lang="PT-BR"><br></span></div><div class="MsoNormal" style="margin-bottom: 0.0001pt; line-height: normal;"><span style="font-size: 8pt;" lang="PT-BR">---</span></div> <div class="MsoNormal" style="margin-bottom: 0.0001pt; line-height: normal;"><span style="font-size: 8pt;" lang="PT-BR"> <font size="1">&nbsp;</font></span></div><font size="1">Ricardo O. S. Soares , PhD Student.<br>Group of Biological Physics - Department of Physics &amp; Chemistry<br>Faculty of Pharmaceutical Sciences at Ribeirão Preto - University of São Paulo.</font><span style="font-size: 8pt;" lang="PT-BR">&nbsp;</span> </div></div></div></body></html>