<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:verdana, helvetica, sans-serif;font-size:10pt"><div>Greetings GrOmAcS Users,</div><div><br></div><div>I want to calculate the free energy, for different (de)protonation states, of a certain compound.</div><div>This requires to edit by hand many topology files.</div><div><br></div><div>Is there a code that can do it on-the-fly or any ideas(algorithm) how it can be done automatically?</div><div><br></div><div><br></div><div>Thanks in advance for your help<br></div></div></body></html>