Hello Justin,<div><br></div><div>In your membrane protein simulation tutorial after making the topology, you have mentioned that &quot;<span class="Apple-style-span" style="font-family: Arial; font-size: medium; ">Placing the new gromos53a6_lipid.ff directory in $GMXLIB will allow you to use this force field system-wide.</span>&quot; I suppose this is valid only for the proteins (and not membranes) to be processed through pdb2gmx using gromos53a6_lipid force-field, right? And to process a membrane using pdb2gmx we need to change the aminoacids.rtp file with the relevent POPC/DSPC/DPPC etc. entries. Right? Or can we somehow make pdb2gmx use the POPC/DPPC/DSPC.itp file?</div>
<div><br></div><div><br></div><div>Thanks a lot.</div><div><br></div><div>Anirban</div>