<br><br><div class="gmail_quote">2011/12/14 陈应广 <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:525342307@qq.com">525342307@qq.com</a>&gt;</span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

<div><div></div><div class="h5"><div> </div>
<div><u></u>
<div> </div>
<div> </div>
<div style="COLOR:#000">
<div>Dear gromacs users</div>
<div> </div>
<div>     I used Gromacs in order to get a MD simulation of Glycoproteion.now I have got the Glycoproteion&#39;s PDB file,When I want to MD by GMX,it gave a Warnning:Fatal error: Residue &quot;....&quot;not found in residue topology database. And I know it was because of the force field,I want to know which force field should be choose in GMX,And where I can get the force field?? <i>Any suggestions?<br>

</i></div></div></div></div></div></blockquote><div><br>I guess you have to check the residue names, especially those glyco parts, which are probably not in the force field you chose.<br> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">

<div><div class="h5"><div><div style="color:rgb(0,0,0)"><div><i></i> That&#39;s all.</div>
<div> </div>
<div> </div>
<div>    Thank  you</div></div><u></u></div></div></div><br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br>