
<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:verdana, helvetica, sans-serif;font-size:10pt"><div>Dear GRomacs users,</div><div><br></div><div>I am using the -rerun option of mdrun to read the coordinates of a trajectory and to compute the potential energy of a molecule during MD. <br></div><div>This operation when performed in parallel, using mdrun_mpi, the energy of the bonded interactions is not computed. But using one core, with the option -nt 1, all interactions are computed. <br></div><div><br></div><div>I am using the md-vv integrator.</div><div><br></div><div><br></div><div>Thanks in advance for your help<br></div></div></body></html>