<div> how to use gromacs 4.5.5&#39;s temple</div><div> Dear teacher,</div><div> i have already modify the code, and also make it.</div><div>Attached is my modified code good. </div><div>&gt;&gt; Dear teacher,</div><div>&gt;&gt; how to use gromacs 4.5.5&#39;s  temple?</div>
<div>&gt;</div><div>&gt;I expect that it is not meant to be functional. It&#39;s meant to be a</div><div>&gt;template from which you can write functional code without having to work</div><div>&gt;too hard on making it work like GROMACS tools work.</div>
<div>&gt;</div><div>&gt;Mark</div><div>&gt;</div><div>&gt;&gt;</div><div>i make the temple successful! And when i run it (./template -f traj.xtc -s water.tpr -cutoff 2),</div><div>the output like this:</div><div><br></div>
<div>&quot;</div><div>Reading file water.tpr, VERSION 4.5.5 (single precision)</div><div>Reading file water.tpr, VERSION 4.5.5 (single precision)</div><div><br></div><div>Specify a reference selection:</div><div>(one selection per line, &#39;help&#39; for help)</div>
<div>&gt; help</div><div>SELECTION HELP</div><div><br></div><div>This program supports selections in addition to traditional index files.</div><div>Please read the subtopic pages (available through &quot;help topic&quot;) for more</div>
<div>information. Explanation of command-line arguments for specifying selections</div><div>can be found under the &quot;cmdline&quot; subtopic, and general selection syntax is</div><div>described under &quot;syntax&quot;. Available keywords can be found under &quot;keywords&quot;,</div>
<div>and concrete examples under &quot;examples&quot;. Other subtopics give more details on</div><div>certain aspects. &quot;help all&quot; prints the help for all subtopics.</div><div><br></div><div>Available subtopics:</div>
<div>  cmdline  syntax  positions  arithmetic  keywords  evaluation  limitations</div><div>  examples</div><div>&gt;</div><div><br></div><div>&quot;</div><div><br></div><div>thanks!!</div><div>Regards,</div><div>Bodu</div>
<div>Department of Polymer Science and Engineering,</div><div>School of Chemical Engineering and technology,</div><div>Tianjin University, Weijin Road 92, Nankai District 300072,</div><div>Tianjin City P. R. China</div><div>
Tel/Fax: +86-22-27404303 ; +8613820062885</div><div>E-mail: <a href="mailto:2008dubo@gmail.com">2008dubo@gmail.com</a> ; <a href="mailto:dubo2008@tju.edu.cn">dubo2008@tju.edu.cn</a></div>