<span class="Apple-style-span" style="font-family:Times;font-size:medium"><pre>Dear users,

Force field: 53a6

water model: spcTermini : NH3+ and COO-</pre><pre>After the command:<span class="Apple-style-span" style="font-family:Helvetica;white-space:normal"><span class="Apple-style-span" style="font-size:small">pdb2gmx -f ${MOL}.pdb -o ${MOL}.gro -p ${MOL}.top -ter -merge -ignh</span></span>

I have the following error:

Fatal error:

Atom LPG1 in residue CYS 143 was not found in rtp entry CYSH with 8 atoms

while sorting atoms.

What is the appropriate atom type corresponding to LPG1 and LPG2 for cysteine?</pre><pre><br></pre><pre>Thanx</pre><pre>Anu</pre></span>