Dear GMX users,<br>I have a question about 6th gromacs tutorial.<br>I have to perform 5 steps of calculation contain:<br>1) EM-1<br>2) EM-2<br>3) NVT<br>4) NPT<br>5) Product MD<br>for each Lambda value from 0 up to 1.<br>I have a .gro file contains initial coordinates of my system : drg.gro<br>
For lambda = 0.00 I have done 5 steps (above) and its results is : md0.gro (from MD-Production)<br>my question is should I use md0.gro for next calculations ( lambda = 0.05) or I have to apply drg.gro file again?<br>Thank in advance.<br>
P.Haghighi<br>