<div>Dear Gmx Users,</div>
<div> </div>
<div>I am wondering whether any of you faced a problem of predicting terminal of the protein. I submitted my sequence to the software like ITASSER or LOMETS and obtined some models forming loops which are expected. The confidence of those models (as this is terminal) are not so high and I am wondering whether I will confirm sencondary structure of my protein exeprimentally (CD exepriment) I can trust and choose one of models formed by the server? Please, let me know if you had similar problem in your past. </div>

<div>I am writing this message on this forum as many people are studiyng proteins in Gromacs. If you can suggest other mailing list I would be grateful.</div>
<div> </div>
<div>Thank you,</div>
<div> </div>
<div>Steven</div>