<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
</head>
<body ocsi="0" fpstyle="1" bgcolor="#ffffff">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">I have already done that but the problem persisits.<br>
<br>
<div style="font-family: Times New Roman; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 16px;">
<hr tabindex="-1">
<div style="direction: ltr;" id="divRpF880567"><font color="#000000" face="Tahoma" size="2"><b>From:</b> gmx-users-bounces@gromacs.org [gmx-users-bounces@gromacs.org] on behalf of Javier Cerezo [jcb1@um.es]<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, January 11, 2012 1:56 PM<br>
<b>To:</b> gmx-users@gromacs.org<br>
<b>Subject:</b> Re: [gmx-users] (no subject)<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>Hi<br>
<br>
You should compile your fftw with --enable-shared if you want to link your gromacs installation to shared libraries (which is the default in the latest versions). Check the installation instructions in the website.<br>
<br>
Javier<br>
<br>
El 11/01/12 08:20, Anik Sen escribió:
<blockquote type="cite"><style id="owaParaStyle" type="text/css">
<!--
p
        {margin-top:0;
        margin-bottom:0}
-->
BODY {direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;}P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>
<div style="direction: ltr; font-family: Tahoma; color: rgb(0, 0, 0); font-size: 10pt;">
<font size="3"><span style="font-family: Times New Roman;">Im having problems installing Gromacs. I followed the GROMACS installation instructions as suggested by justin</span></font>. But in vain. The same error is coming again and again. Please suggest.<br>
<br>
The error file is given below:<br style="font-family: Times New Roman;">
<font size="4"><br>
<br style="font-family: Times New Roman;">
</font>
<p style="text-align: left; font-family: Times New Roman;"><font size="4"><b><font>/usr/bin/ld: /usr/local/lib/libfftw3.a(<wbr>plan-dft-r2c-3d.o): relocation R_X86_64_32 against `a local symbol' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC</font></b></font></p>
<p style="text-align: left; font-family: Times New Roman;"><font size="4"><b><font>/usr/local/lib/libfftw3.a: could not read symbols: Bad value</font></b></font></p>
<p style="text-align: left; font-family: Times New Roman;"><font size="4"><b><font>collect2: ld returned 1 exit status</font></b></font></p>
<p style="text-align: left; font-family: Times New Roman;"><font size="4"><b><font>make[3]: *** [<a href="http://libmd_d.la/" target="_blank">libmd_d.la</a>] Error 1</font></b></font></p>
<p style="text-align: left; font-family: Times New Roman;"><font size="4"><b><font>make[3]: Leaving directory `/home/ganguly/Gromacs/<wbr>gromacs-4.5.5/src/mdlib'</font></b></font></p>
<p style="text-align: left; font-family: Times New Roman;"><font size="4"><b><font>make[2]: *** [all-recursive] Error 1</font></b></font></p>
<p style="text-align: left; font-family: Times New Roman;"><font size="4"><b><font>make[2]: Leaving directory `/home/ganguly/Gromacs/<wbr>gromacs-4.5.5/src'</font></b></font></p>
<p style="text-align: left; font-family: Times New Roman;"><font size="4"><b><font>make[1]: *** [all] Error 2</font></b></font></p>
<p style="text-align: left; font-family: Times New Roman;"><font size="4"><b><font>make[1]: Leaving directory `/home/ganguly/Gromacs/<wbr>gromacs-4.5.5/src'</font></b></font></p>
<p style="text-align: left; font-family: Times New Roman;"><font size="4"><b><font>make: *** [all-recursive] Error 1</font></b></font></p>
<p style="text-align: left;"><br>
</p>
<p style="text-align: left;"><br>
</p>
Thanx in advance<br>
Anik<br>
</div>
<div style="font-size: 9pt; font-family: 'Calibri',sans-serif;">========================================================<br>
Anik Sen<br>
Student<br>
CSIR-Central Salt &amp; Marine Chemicals Research Institute,<br>
Gijubhai Badheka Marg.<br>
Bhavnagar, Gujarat 364002<br>
<div><img alt="www.csmcri.org" src="http://www.csmcri.org/images/logo.png"></div>
========================================================</div>
<br>
<fieldset class="mimeAttachmentHeader" target="_blank"></fieldset> <br>
</blockquote>
<br>
<pre class="moz-signature" cols="72">-- 
Javier CEREZO BASTIDA
PhD Student
Physical Chemistry
Universidad de Murcia
Murcia (Spain)
Phone: (&#43;34)868887434</pre>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>