<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div>Hi everyone!</div><div><br></div><div>On this page</div><div><br></div><div>http://manual.gromacs.org/online/g_hbond.html</div><div><br></div><div>there is an option -r2 when using g_hbond. What is this r2? I can't find it in the Gromacs manual. option -a is the angle H-O-O, option -r is the O-O distance which can be switched to H-A by using the "-da no". Need help on what is -r2 (could this be for specifying a third criterion for the for distance O-H in addition to the angle cut-off and O-O distance cut-off).</div><div><br></div><div>Thanks!</div><br>Bernard<br></div></body></html>