<html><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><div>Dear justin Thank you for your previous reply</div><div><br></div><div>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; I have solvated&nbsp; my protein molecule with specific number of water molecules By keeping the protein (solute) at center of box (option available in editconf)&nbsp; but when i visualize the resultant&nbsp; .gro file in VMD&nbsp; the solute molecule are not closely surrounded by&nbsp; water molecules <span style="font-weight: bold;">i need Solute&nbsp; molecules to be&nbsp; closely surrounded by&nbsp; solvent molecules&nbsp;</span><span style="font-weight: bold;"> without changing the
 dimension of box i am using Cubic box </span>is there is any option in available in gromacs</div><div>With Cheers</div><div>S.vidhyasankar</div><div>Thanks in&nbsp; advance<br></div><div><br></div><div><br></div></div></body></html>